Cite this article as:
Элькин М. Д., Панкратов А. Н., Джалмухамбетова Е. А., Алыкова О. М. Структурно-динамические модели и спектроскопическая идентификация димеров урацила и азаурацилов. Izvestiya of Saratov University. Chemistry. Biology. Ecology, 2013, vol. 13, iss. 2, pp. 15-23. DOI: https://doi.org/10.18500/1816-9775-2013-13-2-15-23
Структурно-динамические модели и спектроскопическая идентификация димеров урацила и азаурацилов
В рамках метода теории функционала плотности на основании модельных квантовохимических расчетов параметров адиабатического потенциала димеров урацила, 5- и 6-азаурацилов предложена интерпретация колебательных состояний соединений. Выявлены признаки спектроскопической идентификации веществ.
1. Fulara J., Nowak M. J., Lapinski L. Theoretical and matrix-isolation experimental study of the infrared spectra of 5-azauracil and 6-azauracil // Spectrochim. Acta. 1991. Vol. 47A, № 5. P. 595–613.
2. Potter B. S., Palmer R. A., Withnall R., Chowdhry B. Z. Aza analog of nucleic acid bases: Infrared spectra of 5-azauracil and crystal structure of 5-azauracil monohydrate // New J. Chem. 1999. Vol. 23, № 1. P. 117–122.
3. Тен Г. Н., Бурова Т. Г., Баранов В. И. Анализ ИК спектров и водородных связей урацила // Журн. структур. химии. 2001. Т .42, № 4. С. 666–676.
4. Mitran R. A., Bascornea A. C. Some unusual spectral properties of 6-azauracil derivatives // U.P.B. Sci. Bull. Ser. B. 2011. Vol. 73, № 1. P. 67–74.
5. Свердлов Л. М., Ковнер М. А., Крайнов Е. П. Колебательные спектры многоатомных молекул. М.: Наука, 1970. 550 с.
6. Элькин П. М., Пулин О. В., Джалмухамбетова Е. А. Структурно-динамические модели и ангармонический анализ колебательных состояний замещенных урацила // Вестн. Сарат. гос. тех. ун-та. 2005. № 4(9). С. 36–45.
7. Элькин П. М., Эрман М. А., Пулин В. Ф. Анализ колебательных спектров метилзамещенных урацила в ангармоническом приближении // Журн. прикл. спектроск. 2006. Т. 73, № 4. С. 431–436.
8. Элькин М. Д., Джалмухамбетова Е. А., Гречухина О. Н. Проявление межмолекулярного взаимодействия в димерах урацила // Изв. Сарат. ун-та. Нов. сер. Сер. Физика. 2008. Т. 8, вып. 2. С. 24–30.
9. Hoy A. R., Mills I. M., Strey G. Anharmonic force constants calculation // J. Mol. Phys. 1972. Vol. 21, № 6. P. 1265–1290.
10. Элькин М. Д., Бабков Л. М. Учет ангармонического смещения полос в модельных расчетах колебательных спектров димеров с водородной связью // Изв. Сарат. ун-та. Нов. сер. Сер. Физика. 2011. Т. 11, вып. 1. С. 20–25.
11. Frisch M. J., Trucks G. W., Schlegel H. B., Scuseria G. E., Robb M. A., Cheeseman J. R., Zakrzewski V. G., Montgomery J. A., Stratmann R. E., Burant J. C., Dapprich S., Millan J. M., Daniels A. D., Kudin K. N., Strain M. C., Farkas O., Tomasi J., Barone V., Cossi M., Cammi R., Mennucci B., Pomelli C., Adamo C., Clifford S., Ochterski J., Petersson G. A., Ayala P. Y., Cui Q., Morokuma K., Malich D. K., Rabuck A. D., Raghavachari K., Foresman J.B., Cioslowski J., Ortiz J. V., Baboul A. G., Stefanov B. B., Liu G., Liashenko A., Piskorz P., Komaromi I., Gomperts R., Martin R. L., Fox D. J., Keith T., Al-Laham M. A., Peng C. Y., Nanayakkara A., Gonzales C., Challacombe M., Gill P. M. W., Johnson B., Chen W., Wong M. W., Andreas J. L., Head-Gordon M., Reploge E. S., Pople J. A. Gaussian 03, Revision B.03. Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003.
12. Общая органическая химия / под ред. Д. Бартона, У. Д. Оллиса. Т. 10. Нуклеиновые кислоты, аминокислоты, пептиды, белки / Е. Хаслам, Г. М. Блэкборн, Р. Т. Уокер, Д. В. Хатчинсон, П. М. Харди, Д. Т. Элмор, Б. В. Бикрофт, Г. Лоу, Р. С. Шепард, Дж. С. Баррет, А. Дж. Кирби, Г. К. С. Вуд, Б. Т. Голдинг; под ред. Е. Хаслама. М.: Химия, 1986. 704 с.
13. Colarusso P., Zhang KeQing, Guo Bujin, Bernath P. F. The infrared spectra of uracil, thymin, and adenine in the gas phase // Chem. Phys. Lett. 1997. Vol. 269, № 1–2. P. 39–48.
